Draft

基本情報と固有コマンド

Published

May 11, 2025

Abstract
ディレクトリ構成などの基本情報のほか,ジョブ投入などに関係した固有のコマンドを紹介します

Miyabiのアカウントは,申請に応じてグループに紐づいています.以下ではそのグループ名を ${group} 変数で表します.また,${user} が個人ユーザーIDを表すとします.

ディレクトリ構成

ディレクトリは

  • ホーム /home/${user}
  • ワーク /work/${group}/${user}
  • 共有 /work/${group}/${share}

です.ホームディレクトリ・ワークディレクトリの基本パーミッションは700で,他の人は読み書きできません.グループ内で共有するファイルは共有ディレクトリをご利用ください.

自分のグループ番号がわからない場合は,id コマンドで調べることができます.著者の例だと以下のようになります.

$ id
uid=49177(k64002) gid=49177(k64002) groups=49177(k64002),21949(gz06),22526(gi23)

gid のあとの数字に付随した括弧内の文字列がグループ名です.ひとつめは自分地震だけのグループ(uidと同一番号),そのあとに表示されるものが申請に紐づいたグループ(上記の場合は gz06gi23)です.複数のグループから申し込みをすることで,同じアカウントで複数のグループに所属することがあります.

ホームディレクトリは容量が小さいため,コードの開発や管理はホームディレクトリで,計算はワークディレクトリでやることを推奨します.

Tip

Miyabiでは他の東大情報基盤センターのシステムとは異なり,ホームディレクトリからもジョブの実行ができるようです.一方で,後述するようにホームディレクトリのファイル数制限が厳しいため,やはりジョブ実行はワークディレクトリから行うことを勧めます.

固有コマンド

ジョブの投入関係のコマンドは後述します.

qstat

投入した計算ジョブの状況を確認するためのコマンドです. その他の使い方として,--nodeuse オプションをつけると,現在のシステムの使用状況(混雑状況)を知ることができます.

$ qstat --nodeuse
SYSTEM: Miyabi-G
QUEUE                                                Ratio Used/Total(Node)
debug-g/interact-g            ***-----------------     15%       7/  48
short-g                       ****----------------     21%       5/  24
regular-g                     ***-----------------     19%     181/ 960
coupler-g                     --------------------      0%       0/ 960
special-g                     --------------------      0%       0/  12

SYSTEM: Miyabi-C
QUEUE                                                Ratio Used/Total(Node)
debug-c/interact-c            --------------------      0%       0/  16
short-c                       --------------------      0%       0/   6
regular-c                     *-------------------      7%      11/ 168
coupler-c                     --------------------      0%       0/ 168

SYSTEM: Prepost
QUEUE                                                Ratio Used/Total(Node)
prepost                       --------------------      0%       0/   1

show_token

計算資源の使用状況を確認するコマンドです.同じ情報はWebの利用支援ポータルからも確認できます.

show_quota

ディスクの使用状況を確認するコマンドです.同じ情報はWebの利用支援ポータルからも確認できます.